Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms