Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms