Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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