Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGNBQ7Z5D8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms