Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms