Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF628Q5EBL2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms