Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms