Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms