Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms