Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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