Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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