Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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GABRA6Q16445 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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GABRA6Q16445 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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GABRA6Q16445 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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