Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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