Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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