Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CST6Q15828 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CST6Q15828 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CST6Q15828 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CST6Q15828 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CST6Q15828 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CST6Q15828 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms