Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms