Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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