Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms