Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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