Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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