Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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