Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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