Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CDH18Q13634 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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