Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms