Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RPA4Q13156 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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