Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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