Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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