Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCP2Q13094 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCP2Q13094 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms