Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
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