Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NPRL3Q12980 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPRL3Q12980 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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