Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALNT1Q10472 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms