Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms