Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms