Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms