Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms