Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms