Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIM1P81133 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIM1P81133 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms