Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms