Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME5P56597 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME5P56597 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms