Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH12P55289 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms