Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms