Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms