Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFBP38117 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFBP38117 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFBP38117 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFBP38117 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFBP38117 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFBP38117 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms