Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOX11P35716 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOX11P35716 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX11P35716 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms