Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms