Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASQ1P31415 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CASQ1P31415 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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