Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CPS1P31327 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPS1P31327 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms