Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms