Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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