Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms